《表1 槲皮素分子对接分数》

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注:MAPK1为丝裂原活化蛋白激酶1;PTGS2为前列腺素内过氧化物合酶2;TNF为肿瘤坏死因子;VEGFA为血管内皮生长因子A;TP53为抑癌基因p53。

选择方中主要化合物槲皮素(quercetin)和关键作用靶点TP53、PTGS2、VEGFA、TNF、MAPK1进行分子对接,见图10,对接分数见表1,其中MAPK1、PTGS2、TNF的结合力最好。由图10-a知槲皮素与MARK1的结合能量(glide gscore)为-7.432 kcal/mol,槲皮素苯环上的羟基与Asp176、Glu71形成了两个氢键,苯环与Lys54形成了盐桥作用,双环系统上的羟基与Met108形成了一个氢键,与配体形成van der waals接触的氨基酸残基数目较多,配体嵌入蛋白空腔内部,进入较深,结合状况良好。由图10-b知槲皮素与PTGS2的glide gscore为-6.871 kcal/mol,槲皮素双环系统上的羟基部分与Hie214、Thr212分别形成氢键,两个芳环与His207、His386均形成Pi-Pi堆积作用,配体深入蛋白结构的空腔内部,与较多氨基酸残基形成van der Waals接触,结合较牢固。10-c知槲皮素与该TNF受体对接,仅形成一个氢键,苯环上的羟基与Gly121形成的一个氢键,配体虽然结合在受体蛋白的大沟中,但因空腔体积较大,仍然有较多的配体暴露区域,与配体形成van der Waals接触的氨基酸残基数目较少。