《表5 离子液体与木瓜蛋白酶分子对接的对接参数》

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《[C_4mim]BF_4、[C_4Py]Cl离子液体与木瓜蛋白酶相互作用的荧光光谱分析和分子对接》

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注：Evdw.分子的对接内能；Eele.分子内部结构转动所消耗的动能；K.抑制常数。

离子液体与木瓜蛋白酶的分子对接，选取结合能最低的对接构像为最优构像，从软件Auto Dock Tools中获取离子液体与酶作用的模拟对接参数（表5）。由表5可知，离子液体的阳离子与木瓜蛋白酶的结合?G均小于0，且[C4Py]Cl的?G小于[C4mim]BF4，由此说明离子液体小分子与木瓜蛋白酶的结合是自发进行的，[C4Py]Cl与木瓜蛋白酶的结合优于[C4mim]BF4。通过软件分析可知，离子液体与木瓜蛋白酶的结合结构如图2所示，只存在一个结合位点，其位于木瓜蛋白酶结构域中间活性部位的凹槽内，通过对木瓜蛋白酶表面作疏水性分析，离子液体完全处于木瓜蛋白酶的疏水性凹槽内，由此可以得出离子液体与木瓜蛋白酶之间存在较强的疏水相互作用，同时通过软件分析发现还存在范德华力和π-π相互作用。分子对接的结果与荧光光谱的结果相一致，同时也证明荧光光谱结果的正确性。