《表3 基于D-loop区序列变异信息的藏鸡单倍型分类》

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《藏鸡线粒体基因组特征及系统发育进化》

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NC007235为标准序列，变异位点竖读4个数字组合为碱基位置，如：0133代表这个碱基位于线粒体D-loop区的133位置

通过测序和拼接，40只藏鸡线粒体D-loop区序列长度为1 231～1 232 bp，除2只为1 231 bp外（859 bp处C碱基缺失），其余均为1 232 bp。T、C、A和G 4种碱基含量分别为33.5%、26.5%、26.7%和13.3%，其中A+T含量（60.2%）明显高于G+C含量（39.8%），表现出一定的碱基偏好性。共发现17个变异点（表3），占研究序列长度的1.38%（17/1231），其中单一位点突变（singleton variable）位点8个（217，222，243，256，261，310，330，446）、简约信息（parsimony informative）位点9个（133，167，212，225，246，296，315，792，1215）。