《表4 ITS序列的8种单倍型的变异位点比较》
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《云南黄毛草莓的nrDNA ITS和cpDNA psbA-trnH序列分子鉴定及进化特征分析》
*表示碱基与单倍型Hap1相同。表5同
利用MEGA 6.0对所有的黄毛草莓ITS序列进行比对,对位排列后得到668 bp的恒定序列,其中包括649个保守位点、10个变异位点、7个简约信息位点和9处插入/缺失位点,变异位点百分率为1.80%,G+C含量为63.2%~63.8%。其中,9处插入/缺失位点分别位于ITS序列的2、5、6、8、12、13、14、20和665 bp位点。ITS序列共有8种单倍型(表4),Hd为0.894±0.078,π为0.006。8种单倍型中,Hap5分布于文山州广南县(T17)、文山州富宁县(T18)、文山州砚山县(T19)和文山州马关县(T21)的黄毛草莓样品中,Hap8分布于迪庆州维西县保和镇(T17-23)和迪庆州维西县白济汛乡(T17-46-2)的黄毛草莓样品中,其余单倍型均为私有单倍型。Hap1只存在于昆明市嵩明县的黄毛草莓样品(T1)中,Hap2只分布于昆明市盘龙区的黄毛草莓样品(T2)中,Hap3只分布于昆明市富民县的黄毛草莓样品(T3)中,Hap4只分布于昆明市禄劝县的黄毛草莓样品(T4)中,Hap6只分布于迪庆州德钦县的黄毛草莓样品(T45)中,Hap7只分布于迪庆州香格里拉市的黄毛草莓样品(T46)中(表4)。综上所述,昆明市黄毛草莓样品存在4种单倍型(Hap1、Hap2、Hap3和Hap4),文山州黄毛草莓样品存在1种单倍型(Hap5),迪庆州黄毛草莓样品存在3种单倍型(Hap6、Hap7和Hap8)。
图表编号 | XD00156691100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 杨俊誉、魏世杰、苏代发、陈杉艳、罗志伟、沈雪梅、Arslan Jamil、童江云、崔晓龙 |
绘制单位 | 云南大学生命科学学院、昆明市农业科学研究院、云南大学生命科学学院、昆明市农业科学研究院、昆明市农业科学研究院、昆明市农业科学研究院、云南大学生命科学学院、昆明市农业科学研究院、云南大学生命科学学院 |
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