《表2 Pyrenophora graminea 5个单倍型的ITS序列差异位点》

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《青海省青稞条纹病菌遗传多样性分析》


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注:所有单倍型序列比对以单倍型H1为基准,表头数字表示核苷酸变异位点,“.”表示该位点核苷酸相同于单倍型H1。

所有变异位点共定义了5个单倍型(表2),H1包含70个菌株,菌株源于青海青稞主要种植区。2个单倍型(H2和H3)菌株(DLXRD1和DLXRD2)采自海西蒙古族自治州都兰县香日德镇。其余2个单倍型(H4和H5)的菌株(LDMY1、LDMY2和GNSD2)分别采自海东市乐都县马营乡和海南藏族自治州贵南县森多乡。结果表明,该段序列具有较低的遗传多样性水平。根据DNAsp软件分析,得到多态位点有18个,占总位点的3.16%,其中有8个位点是因为碱基缺失造成的。这18个多态性位点中单类型多态性位点有14个,简约性信息位点有4个,没有3种或4种多态性位点。分析表明,Pyrenophora graminea的该段序列较为保守,突变也较为随机,仅有点突变。