《表4 3个cpDNA序列共产生9个单倍型的变异位点》

《表4 3个cpDNA序列共产生9个单倍型的变异位点》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《基于nSSR和cpDNA序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

3对引物的扩增序列在去除边缘不可靠部分后,分别获得了473 bp(rbc L)、704 bp(mat K)和320 bp(psb H-trn A)的片段序列,序列特征信息见表4。rbc L序列的变异位点共2个,分别在33 bp(A\\C)和463 bp(T\\G)处的颠换,占扩增位点数的0.42%;mat K序列的变异位点共5个,分别为37 bp、147 bp、381 bp的C\\T颠换,128 bp的A\\C颠换和602 bp的G\\C转换,占扩增位点数的0.71%;trn H-psb A序列的变异位点共4个,占扩增位点数的1.25%,分别为239、240、241 bp重复序列A的碱基缺失和308 bp的C\\T颠换。将3个序列依次拼接,共产生了9种单倍型,其中城步峒茶5个居群共有8种(图1-A),外类群黄泥河大茶有1种(H9)。单倍型数从多到少的居群依次为TXZ(H1、H2、H4、H5、H7、H8)、DZC(H1、H2、H3、H4)、DPS(H1、H4、H5、H6)、TYS(H1、H4、H5)、HJZ(H1、H5);居群的Hd和π的大小顺序不一致(表3),Hd最大的为居群TXZ,最小的为居群HJZ,π最大的为居群HJZ,最小的为居群DZC。城步峒茶群体的Hd和π分别为0.732和0.001 39,群体遗传多样性相对较高。