《表5 黄毛草莓psb A-trn H序列5种单倍型的变异位点比较》

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《云南黄毛草莓的nrDNA ITS和cpDNA psbA-trnH序列分子鉴定及进化特征分析》

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利用MEGA 6.0对所有的黄毛草莓psb A-trn H序列进行比对，对位排列后得到203 bp的恒定序列，其中包括198个保守位点、5个变异位点和3个简约信息位点，无插入/缺失位点，变异位点百分率为2.5%，G+C含量为18.7%～19.7%。psb A-trn H序列共有5种单倍型（表5)，Hd为0.788±0.090，π为0.009。Hap4分布于文山州广南县（P17）、文山州砚山县（P19）、迪庆州维西县保和镇（P17-23）、迪庆州香格里拉县（P46）和迪庆州维西县白济汛乡（P17-46-2）的黄毛草莓样品；Hap3分布于昆明市禄劝县（P7）、文山州富宁县（P18）和文山州马关县（P21）的黄毛草莓样品；Hap2分布于昆明市盘龙区（P5）和昆明市富民县（P6）的黄毛草莓样品；Hap1仅分布于昆明市嵩明县（P1）的黄毛草莓样品，Hap5仅分布于迪庆州德钦县（P45）的黄毛草莓样品（表5）。综上所述，psb A-trn H序列的5种单倍型中，单倍型Hap4的黄毛草莓样品数量最多，昆明市黄毛草莓样品存在3种单倍型（Hap1、Hap2和Hap3），文山州黄毛草莓样品存在2种单倍型（Hap3和Hap4），迪庆州黄毛草莓样品存在2种单倍型（Hap4和Hap5）。