《表3 东北亚粳稻Pita基因功能序列变异位点与单倍型》

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《稻瘟病抗性基因Pita在中日韩粳稻中的分布》

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注:-:与一行碱基相同；*:功能位点

应用引物Pita 2-F/Pita 2-R对来源有利群体和不利群体的415份供试材料基因组DNA进行扩增，扩增片段用后引物Pita 2-R进行测序，对所获得序列的609个碱基（位于基因第2 179位至第2 787位，包含了Pita基因功能位点和终止子）进行比较分析。通过比较分析，415份材料仅在第2 388位，第2 752位，第2 766位等3个位点发生了变异；根据功能位点第2 752位上的碱基（G/T），材料分为抗或感，抗性品种中仅一种单倍型（H1），在此片段上与越南抗性品种‘Tetep’一致，感病品种中发现三种单倍型（H2，H3，H4），其中H2是优势单倍型，占本群的84.84%，在此片段上这种单倍型与日本晴一致。可见，东北亚粳稻品种在Pita基因功能片段上变异位点少，单倍型数量少（表3）。