《表1 目前已发现的针对不同类型氨基酸的LAAO总结》
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《L-氨基酸氧化酶的结构、底物谱、家族进化及应用研究进展》
随着对LAAO研究的不断深入,越来越多的底物专一性LAAO被发现,这些底物专一性的LAAO大多是微生物来源的.通过对目前已报道的底物专一性LAAO进行总结比较发现,底物专一性LAAO种类分布与底物氨基酸类型(极性、电荷等)呈现一定的规律性(表1).在非极性脂肪族侧链氨基酸中,除了特异性的甘氨酸氧化酶被发现外[35-36],其他如L-丙氨酸、L-脯氨酸、L-缬氨酸、L-亮氨酸、L-异亮氨酸、L-甲硫氨酸等氨基酸都没有发现相应的专一性LAAO;所有的极性、不带电荷的侧链氨基酸(L-丝氨酸、L-苏氨酸、L-半胱氨酸、L-天冬酰胺、L-谷氨酰胺)都尚未发现相应的专一性LAAO;在芳香族侧链氨基酸中,除了L-酪氨酸没有发现专一性的LAAO,L-苯丙氨酸、L-色氨酸都发现了多种专一性的LAAO[37-39];所有的酸性侧链氨基酸(L-天冬氨酸、L-谷氨酸)和碱性侧链氨基酸(L-赖氨酸、L-精氨酸和L-组氨酸)也都发现了多种专一性的LAAO[40-47].由此可见,目前发现的底物专一性LAAO多是针对具有带电或芳香族官能团侧链的氨基酸,这种现象可能与酶的底物选择性分子机制有关,即通过改变底物结合口袋的组成氨基酸残基来调节静电作用力、空间位阻等参数,可以比较容易地实现对带电或芳香族侧链氨基酸底物的专一性识别,而较难实现对侧链大小相差不大、不能产生较强的酶-底物作用力的其他氨基酸的专一性识别.另外,有必要通过进一步的研究来考察自然界是否存在针对其他非极性侧链氨基酸的专一性LAAO,以及能否通过蛋白质工程手段获得对其他类型氨基酸具有专一性的LAAO突变体,这将对于深入了解底物特异性机制、探讨自然进化是否存在序列空间的盲区(即无法考察所有可能的突变类型)产生重要启发.
图表编号 | XD00206346500 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2021.01.20 |
作者 | 陆泽林、越皓、张艺凡、于珊珊、杨广宇、马富强 |
绘制单位 | 长春中医药大学吉林省人参科学研究院、中国科学院苏州生物医学工程技术研究所、长春中医药大学吉林省人参科学研究院、中国科学院苏州生物医学工程技术研究所、长春中医药大学吉林省人参科学研究院、上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |