《表3 不同方法预测的基因组结果》

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《杏基因组全新组装及杏的进化分析》

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使用Augustus、Glimmer HMM、SNAP、Gene ID和Gen Scan进行全新（de novo）预测的结果以及利用黑树莓（Rubus occidentalis）、白梨、梅、葡萄（Vitis vinifera）、桃和野草莓进行同源预测的结果如表3所示。杏根、茎和叶等植物组织转录组分析中获得38 191个转录本。使用EVM整合软件，将各种方法预测得到的基因集整合成一个非冗余的基因集，再使用PASA处理，预测出23 445个蛋白质编码基因（包含UTR），平均转录本长度为2 934.41bp，平均编码序列长度为1 143.34 bp，外显子平均为5.05个，外显子长平均为226.19 bp，内含子长平均为441.71 bp。