《Table 1 Partition of internal transportation calculated with the RAMD simulations》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《白腐菌漆酶耐盐性的生物信息学研究及氯离子、氧气和水分子输运通道分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

表1列出了用RAMD模拟方法计算的内部运输分区.可见，在各种初始状态的近百次RAMD模拟尝试中，当氯离子占据氧气X位置与T3-Cu配位时，可观察到不同的释放通道，通过p1a，p2，p3和p4通道释放的比率为12∶3∶1∶1.当氧气处于多铜TNC结合中心时，也观测到多条释放通道，其中p1和p2通道出现的频率相似，而p3通道出现频率远低于前两者.当氯离子起始位于与T2-Cu配位的Y位置时，18次观测到氯离子的释放全部通过p1通道.水分子有13次能在1 ns内离开漆酶，其中11次从p4通道，2次从p5通道释放.氧气的输运可能有多个通道，其中p2通道有一定的优势，而水分子的释放通道主要是p4通道.当氯离子存在时，很有可能通过p1a通道到达TNC多铜活性中心，占据氧气结合位置；或者通过p4通道进入TNC多铜活性中心与T2-铜离子结合.氯离子的优势输运通道与氧气有较大不同，其原因可能是其所带的负电荷及较大的范德华半径.