《表1 候选SNP的基本统计学信息》
采用Affymetrix SNP6.0芯片设计理论检测出906 660个SNP位点,96.74%的SNP位点基因散点图聚类好,分型清楚,检查所有样本的QC Call Rate(Nsp/Sty Overlap),删除样本中低于95%的SNP,保留>95%的样本进入后续分析研究。经过初筛后,采用PLINK软件对全部检测的SNP位点进行质控:(1)删除检出率<90%的SNP样本和基因型;(2)删除远离HWE的SNP基因型;(3)删除MAF(minor allele frequency)P<0.01的SNP的基因型。经PLINK质控后共得到484 730个SNP基因,通过检验计算SNP与疾病关联的显著性,找到26个具有显著性差异的SNP基因,见表1。
图表编号 | XD00198596400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.01 |
作者 | 张磊、戈小虎、史振峰 |
绘制单位 | 新疆医科大学第一附属医院血管甲状腺外科、新疆维吾尔自治区人民医院血管外科、新疆维吾尔自治区人民医院泌尿外科 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |