《表3 云南蓝果树的SNP信息统计》

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《基于简化基因组技术的云南蓝果树群体遗传分析》


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依据材料方法部分给出的SNP检测标准,我们对样本进行了过滤,在经过填补和质控后,共计得到98498个SNP位点,每个样品检测到2029~12470个SNP位点,平均获得4104个SNP位点(表3)。根据样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5、次要基因型频率(MAF)>0.05的选择标准,从这些SNP中筛选出6309个有效SNP,用于群体遗传分析。样本中SNP位点的杂合率为31.32%~81.13%,平均杂合率为63.87%;样本中