《表3 GWAS信号位点与SNP标记信息》

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《黄瓜核心种质幼苗耐低温性评价及GWAS分析》


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利用核心种质苗期耐低温评价指标LTS值数据与SNP标记进行GWAS分析,绘制曼哈顿图(图4)。在Chr.1、Chr.3、Chr.4和Chr.5上检测到与2个批次相关信号位点(图4b,d)。其中Chr.5上相关位点区域在两次低温试验中均被检测到,是一个稳定表达的耐低温位点,以每个信号区域中-log10P值最高的SNP物理位置代表位点区段(表3)。