《表1 测序结果及Alpha多样性分析》

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《烟草根部内生真菌群落结构和功能特征》


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5个样品测序共获得333 475条原始序列,过滤及去除嵌合子后共产生333 396条有效序列,每个样品产生53 274–76 744条有效序列,以97%一致性聚类得到47–69个OTUs。对不同样品的α多样性指数进行比对分析,发现烟草根部内生真菌多样性和丰富度相对偏低。反映内生真菌丰富度的ACE和Chao1指数分别在68.25–82.70和58.00–95.00之间,反映菌群多样性的Shannon和Simpson指数分别在0.41–1.01和0.47–0.83之间。其中,样品K326的内生真菌多样性最丰富,Shannon指数和Chao1指数分别为1.01和0.95。与之相反,CBH品种烟叶根部的内生真菌多样性最低,Shannon指数、Chao1指数分别为0.41和64.80。所有样品文库覆盖度均超过0.99,表明本次测序数据能充分反映样品内生真菌群落结构(表1)。