《表1 各组小鼠粪便样品测序结果及多样性指数》

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《高通量测序研究中药经方对正常小鼠肠道菌群的影响》

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要了解样本测序结果中的菌属等数目信息，就需要对序列进行聚类。通过聚类，将序列按照彼此的相似性分归为许多小组，一个小组就是一个OTU。通常在97%的相似水平下的OTU进行生物信息统计分析。经Illumina测序后，4组40个样本总共获得1 167 427条优化序列，平均每个样本29 186条序列、342个OTUs。其中正常组10个样本，共301 851条序列、3 356个OTUs；四君组10个样本，共295 551条序列、3 387个OTUs；麻杏组10个样本，共289 722条序列、3 592个OTUs；麻四组10个样本，共280 303条序列、3 329个OTUs。经统计，各给药组的干预均对正常小鼠肠道菌群的OTU数量产生影响。除麻四组外，各给药组的OTU数量均升高，麻杏组尤为明显（P<0.05），表明各组药物均能影响正常小鼠肠道菌群的丰富度。各组样品相关信息见表1。