《表3 每个样品的MiSeq测序结果和多样性指数》

《表3 每个样品的MiSeq测序结果和多样性指数》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《干旱区不同类型盐碱土壤细菌群落多样性》


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从图1可以看出,4个样品的稀释曲线基本上趋于平缓,表明测序已趋于饱和,结合样品的覆盖率,说明该测序结果中包含了大多数微生物群类,能够真实地反映4个盐碱土壤样品中微生物的群落组成。本次测序共获得137 822个优化序列,各样本的优化序列数在32 339~37 413之间(表3)。有效序列范围在22 379~23 864,4个样品中的有效序列数量差异较小。氯化—硫酸盐型土壤样品中的OUT最少,碳酸盐型土壤样品检测出较高的OUT。氯化—硫酸盐型土壤样品检测到较高的优化序列数,但其OUT数量、Shannon指数、ACE指数、Chao1均表现最小,表明其在细菌的多样性和丰富度上与另外三种类型盐碱土壤相比均最低。硫酸—氯化物型和硫酸盐型土壤样品在Chao1、ACE指数较为接近,表明这2个样点的菌群丰富度较为相似。Shannon指数表现为:碳酸盐型>硫酸—氯化物盐型>硫酸盐型>氯化—硫酸盐型,硫酸—氯化物型和碳酸盐型土壤的Simpson指数相同,表明二者具有相似的群落多样性。总体来说,在4种不同类型盐碱土壤中,碳酸盐型土壤样品中的细菌群落具有较高的多样性和丰富度。