《表2 模块二的功能富集分析》

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《辐照后非小细胞肺癌差异表达基因的生物信息学分析》

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注：#在表中代表GO类别介导的生物学过程，&在表中代表KEGG通路，*表中的%是应用Cytoscape软件模块二中的算法计算获得可识别的差异基因39个，39个中属于当前每个GO term的差异gene个数/此算法获得差异基因个数，得到的比例即为此百分比。

通过Cytoscape软件的插件MCODE筛选和获取核心子模块网络并进行模块分析，获得两个核心模块。模块一包含11个节点和51条边（图4(a）），节点基因对应蛋白分别为HIST1H4D、HIST1H2AE、HIST1H3F、HIST1H2BF、HIST1H4H、HIST1H4B、HIST1H3B、HIST1H3J、HIST1H2BK、HIST1H2AB和HIST1H3A，椭圆形代表上调基因，菱形代表下调基因。功能主要富集在核小体装配、端粒组织、DNA复制依赖性核小体装配、r DNA上的染色质沉默、蛋白质异四聚体基因表达的负调控、表观遗传、基因表达的正调控，表观遗传、RNA基因沉默、细胞蛋白质代谢过程、基因沉默的调控、凝血、细胞间黏附、巨核细胞分化的负调控、端粒上限、DNA复制非依赖性核小体组装、DNA模板转录起始、β-catenin-TCF复合物组装、包含CENP-A的核小体装配、非同源末端连接进行双链断裂修复、黏膜固有免疫反应、抗菌体液反应、染色质沉默、对革兰氏阳性细菌的防御反应、系统性红斑狼疮、酗酒、病毒致癌、癌症中的转录失调等信号通路（表1）。模块二包含6个节点和15条边（图4(b）），节点基因对应蛋白分别为HIST2H2AB、HIST1H2AH、HIST1H2BM、HIST2H2BF、HIST1H2BO、HIST1H2BH，功能主要富集在核小体装配、染色质沉默、系统性红斑狼疮、酗酒、病毒致癌信号通路（表2）。