《表3 Pac C-H和WT-H中与PCWP降解相关DEGs的信息》

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《基于转录组探究PacC介导的苹果黑腐皮壳菌致病机制》

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PCWP降解酶作为病原菌降解植物细胞壁的重要武器，在真菌致病过程中发挥重要作用。数据显示，在PacC-H和WT-H比较筛选出的DEGs中，有14个DEGs参与戊糖和葡萄糖醛酸转换、氰基氨基酸代谢、淀粉和蔗糖代谢过程，这14个DEGs中有13个与PCWP降解相关，其中8个DEGs上调表达，5个DEGs下调表达（表3）；在PacC-D和WT-D比较筛选出的DEGs中，与这3个通路途径相关的9个基因全部参与PCWP降解（表4），这些DEGs中除了VM1G＿00636上调表达外，其余均下调表达。这13个下调表达基因中更可能包含致病关键基因。本研究通过PHI数据库来预测PCWP降解酶中的潜在致病关键基因，PHI比对结果显示推定的果胶裂解酶A基因（VM1G＿05058）、假想蛋白基因（VM1G＿08430）、果胶裂解酶B基因（VM1G＿10963）可能在苹果黑腐皮壳菌致病过程中发挥重要作用（表5）。与黑腐皮壳菌野生型菌株相比，这3个基因在ΔVm Pac C侵染前期和后期过程中都下调表达，Pac C敲除突变菌株致病能力的减弱与致病关键基因表达量的降低密切相关。