《表8 箭麻和共生天麻中与生长代谢相关关键差异基因的表达情况》

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《基于转录组测序初步揭示天麻生长代谢的分子机制》

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显著差异表达判断标准为FDR<0.05且|log2FC|>1。Fold change(FC）的意思是样本间表达量的差异倍数，log2 fold change的意思是取log2，这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距。|log2FC|>1表示样本间差异表达倍数2倍以上

根据差异基因GO分类、KEGG功能分析和KOG功能注释，对箭麻和共生天麻生长代谢过程的相关基因进行筛选。在箭麻和共生天麻转录组测序数据注释的结果中筛选到与氮代谢、碳代谢和能量代谢相关酶的基因序列。在氮代谢途径中，选取了差异表达的基因GS、ASNS、GDH、Argase；在碳代谢中选取了差异表达的基因Su Sy、SSS、AGPase、AMS；在能量代谢中选取了差异表达的基因PK、HK、PDH、MDH、IDH、ATPase（表8）。从这些基因的表达趋势来看，与合成氮，碳和能量的酶基因大部分呈上调，除分解能量的酶基因上调外，分解氮，碳的酶基因呈下调。说明蜜环菌侵染天麻与天麻共生时共生天麻各种代谢旺盛，合成各种有机物和能量物质。