《表3 氨氮代谢相关差异表达基因》
采用软件Goatools对差异表达基因进行GO富集分析,获得差异表达基因主要具有的GO功能(图1)。上调基因中对与氨氮代谢功能有关的GO条目及候选基因进行筛选,共得到1个GO条目,包含37个DEGs。下调基因中GO条目及候选基因筛选共得到13个GO条目,包含574个DEGs。将DEGs标注到KEGG数据库中,对基因进行KEGG Pathway富集分析,结果显示,共富集到176个信号通路,上调基因与下调基因共同信号通路有130个。在差异基因KEGG富集结果中,挑选了富集最显著的20条通路在图形中展示(图2)。在所有KEGG通路中,对参与枯草芽孢杆菌氨氮代谢通路及候选基因筛选,共得到8个信号通路,包含260个DEGs (表2)。根据对差异表达基因GO与KEGG富集分析中筛选出9个与枯草芽孢杆菌R47对水中氨氮应答的相关基因(表3)。
图表编号 | XD00199954100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.04.01 |
作者 | 郑姚、吴开年、王利、魏勇 |
绘制单位 | 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部和四川省重点实验室、西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部和四川省重点实验室、西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部和四川省重点实验室、四川省畜牧科学研究院 |
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