《表2 A型塞尼卡病毒 (SVA) 全基因序列分段测序引物》

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《A型塞尼卡病毒的分离鉴定及生物学特性研究》


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注:引物序列和位置参考A型塞尼卡病毒(SVA)SVV-001株序列(GenBank登录号:NC_011349)。Notes:Primer sequence and position reference of Senecavirus A(SVA)SVV-001strain sequence(GenBank accession number:NC_011349).

参考SVA SVV-001株全基因序列(GenBank登录号:NC_011349),设计用于分段扩增SVA全基因序列的引物(表2),由擎科泽西生物技术有限公司合成。以总RNA为模板,用反向引物反转录合成cDNA,用高保真聚合酶扩增7个末端重叠的基因片段;用5′RACE和3′RACE方法扩增SVA5′和3′末端。用平末端克隆试剂盒PEASY-Blunt Cloning Kit克隆所扩增基因片段,由擎科泽西生物技术有限公司进行核苷酸序列测定,获得SVA全基因组序列。利用DNAMAN7.0和MEGA6.06分析软件,与GenBank上已公布的SVA毒株的全基因序列进行同源性比对分析,并绘制系统进化树。