《表1 16S r RNA基因同源性》

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《霸王根际解磷细菌的分离与鉴定》


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分别以36株解磷菌的基因组DNA为模板进行16S r RNA基因扩增,部分电泳检测结果见图1。扩增片段测序后,在Ez Taxon数据库中进行同源性分析,结果显示36株菌分属4个纲、15个属,相似度都在99%~100%(见表1、图2)。16株属于放线菌纲(Actinobacteria)类群,其中,GP6、GP7、P2-37-2属于诺卡氏菌属(Nocardioides),GP10、P1-10、P1-58-1、P1-58-2、P1-15、P2-4属于节杆菌属(Arthrobacter),GP12、HP2属于链霉菌属(Streptomyces),GP8、P2-45属于原小单孢菌属(Promicromonospora),P2-31属于红球菌属(Rhodococcus),P2-35-1、P2-37-1属于分支杆菌(Mycobacterium);8株属于厚壁菌门的芽孢杆菌纲(Bacilli)类群,其中,GP20、P3-13、P1-2属于类芽孢菌属(Paenibacillus),HP4、HP4-1、P3-2、P1-12属于芽孢杆菌属(Bacillus),P2-38属于威廉姆氏菌属(Williamsia);10株属于变形菌门的α-变形菌纲(α-Proteobacteria)类群,其中,GP16-1、GP16-2、P1-58、P2-6-1、P3-30属于苍白杆菌属(Ochrobactrum),HP1、HP1-1、HP1-4属于甲基杆菌(Methylobacterium),P2-41属于根瘤菌属(Rhizobium),GP9属于叶杆菌属(Phyllobacterium);2株属于变形菌门的γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)类群,其中,GP22属于泛菌属(Pantoea),P1-13-1属于肠杆菌属(Enterobacter)。其中节杆菌属(6株)占总数的16.7%,为第一优势菌属,苍白杆菌属(5株)占总数的13.9%,为第二优势菌属,芽孢杆菌属(4株)占总数的11.1%,为第三优势菌属。