《表1 mi RNA-455-5p、PIK3R1、AKT1及MTOR合成的引物序列》

《表1 mi RNA-455-5p、PIK3R1、AKT1及MTOR合成的引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《miRNA-455-5p对人结肠癌HT-29细胞株PIK3R1基因靶向调控作用的研究》


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采用q RT-PCR法。将收集的细胞沉淀反转录到cDNA,用sybr染料法进行PIK3R1、AKT1、MTOR mRNA表达的检测。(1)RNA抽提:对样本进行组织研磨、贴壁细胞洗涤、悬浮细胞去培养基等处理后,置于RNaseFree的1.5ml离心管中;加入1 000μl Trizol试剂,剧烈摇晃,静置5min;加200μl氯仿,振荡混匀,室温静置5min;12 000g、4℃离心15min;将上清液转移至新的1.5ml离心管中,加入等体积的异丙醇,室温静置10min;12 000g、4℃离心10min;弃上清液,除尽异丙醇,加入1 000μl75%无水乙醇,12 000g、4℃离心5min;弃上清液,待沉淀干燥后加入DEPC处理水30~50μl;RNA电泳和OD检测质检。(2)引物合成:miRNA-455-5p、PIK3R1、AKT1及MTOR合成的引物序列,见表1。(3)调整RNA浓度,按照实验目的稀释RNA至统一浓度;取一灭菌的无RNA酶的eppendorf管,每个样本加入以下组分,得到MixⅠ共20μl体系:5μg总RNA 5μl,rimer(50μM oligo dT)0.5μl,andom primer 0.5μl,0mM dNTP Mix 1μl,EPC-treated water 5μl;在MixⅠ里加入以下成分,得到MixⅡ共20μl体系:5xFirst-Strand buffer 4μl,0.1M d TT2μl,Naseout(40U/μl)1μl,SuperScripⅢRT(200U/μl)1μl,MixⅠ12μl。反应条件:25℃5min,50℃60min,70℃15min。(4)将获得的引物与cDNA模板进行扩增,反应体系:ddH2O 23μl,10×PCR Buffer 2.0μl,Mg2+(50mM)2.0μl,dNTPs(10mM)0.5μl,Primer F(10μM)0.5μl,SYBR(20×)1.0μl,Primer R(10μM)0.5μl,Taq enzyme(5U/μl)0.2μl,Template 1.0μl,总体积20μl。每个样本反应总量20μl,反应条件:95℃2min,95℃10s,60℃60s,70℃45s,共40个循环;Melt(70~95℃)。采用2-ΔΔCt法计算mRNA相对表达量,ΔΔCt=待测样品(Ct目-Ct内)-对照样品(Ct目-Ct内)。