《表1 本研究中所用引物:番茄匍柄霉叶斑病拮抗细菌的筛选与鉴定》
采用DNA提取试剂盒[天根生化科技(北京)有限公司]提取菌株ZF161的总DNA,利用细菌16S rDNA通用引物27F/1492R(Weisburg et al.,1990)和针对目标基因设计引物gyrB-F/R、atpD-F/R和rpoA-F/R(表1)对菌株ZF161进行PCR扩增。反应体系(50μL):2×Rapid Taq Master Mix(南京诺唯赞生物科技有限公司)25μL、上游引物和下游引物各0.5μL(10μmol·L-1)、DNA模板0.2μL(60 ng·mL-1),ddH2O补足剩余体积。PCR扩增程序均为:95℃10 min;95℃30 s,58℃30s,72℃45 s,34个循环;72℃8 min。PCR产物直接测序(北京博迈德基因技术有限公司)。参与比较分析的序列均来源于GenBank,用MEGA 6.0、Sequence Matrix、Seaview4按顺序连接、比对不同菌株的16S rDNA、gyrB、atpD、rpoA基因,采用最大似然法构建系统发育树,分析其亲缘关系。
图表编号 | XD00178078400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.25 |
作者 | 李新宇、李磊、陈利达、石延霞、柴阿丽、谢学文、李宝聚 |
绘制单位 | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所、沈阳农业大学植物保护学院、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
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