《表1.11株L.reuteri基因组拼接质量与基本特征》

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《比较基因组学分析不同来源罗伊氏乳杆菌基因多样性及生境适应性》

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依据来源将34株L.reuteri分为食草动物、酸马奶、酸粥和酸面团4组，并基于4类菌株的核心基因绘制了Venn图（图3）。结果显示酸马奶、酸粥、酸面团和食草动物分离株分别有459、450、253、404个特异性基因。经KEGG数据库注释后发现酸马奶分离株459个特异基因主要参与丙酮酸代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢、脂肪酸降解、精氨酸生物合成等代谢通路。酸粥分离株450个特异基因主要参与群体感应、泛酸盐和辅酶A生物合成、双组分系统等代谢通路有关。酸面团分离株253个特异基因主要参与精氨酸生物合成、蛋白运输等代谢通路有关。食草动物分离株404个特异性基因主要参与卟啉和叶绿素代谢、叶酸生物合成、阿特拉津降解、氮代谢等代谢通路有关。这些结果表明不同来源的L.reuteri基因功能较为广泛且具有宿主特异性。