《表1 红豆杉科与三尖杉科8种植物叶绿体基因组基本特征的比较》

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《白豆杉的叶绿体基因组结构与系统进化分析》

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本研究测序得到的白豆杉叶绿体基因组全长为130 427 bp，登录号为MN092278（图1）。与其他植物相比，白豆杉的叶绿体基因组长度短于穗花杉属、榧树属和三尖杉属，但长于红豆杉属（表1）。白豆杉叶绿体基因组共编码116个基因，包含83个蛋白编码基因、4个rRNA基因和29个tRNA基因。与穗花杉属和榧树属相比，白豆杉叶绿体基因组的trn I-GAU、trnR-CCG、trn S-GGA发生了丢失。基因组的GC含量为35.18%。其中，蛋白编码区序列的GC含量为36.50%、tRNA为52.36%、rRNA为52.57%、内含子区域为34.61%、间区为29.71%。白豆杉叶绿体基因组的基因密度为每kb具有0.91个基因，相比于其他红豆杉科和三尖杉科植物略高，说明白豆杉拥有更加紧凑的叶绿体基因组结构。白豆杉叶绿体基因组有16个基因含有内含子，其中15个基因含有1个内含子，1个基因含有2个内含子。与其他广义柏类植物类似，白豆杉叶绿体基因组不具有典型的四分体结构，仅残留了长度为552 bp的包含部分chlB和trn Q-UUG基因的小反向重复序列。