《表1 PCR扩增反应体系》

《表1 PCR扩增反应体系》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《小麦重要生育期和入仓阶段籽粒真菌污染及呕吐毒素积累情况分析》


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(1)真菌DNA基因组提取:采用热裂解法[6],用无菌接种针挑取少量菌丝放到盛有100μL超纯水的1.5 m L离心管中,涡旋振荡1 min,充分混匀。10 000 rpm离心30 s,用微量移液器小心弃去上清液。在离心管中加入100μL裂解液,封口膜封口后放入金属浴85℃,20~30 min。粗提物中含有真菌的基因组DNA,放入-20℃保存备用。(2)裂解液成分:50 mmol/L的磷酸二氢钠,1 mmol/L的EDTA(乙二胺四乙酸)和5%甘油,调节pH值到7.4,使用前121℃高压蒸汽灭菌20 min,4℃储藏备用。(3)核糖体DNA中ITS序列扩增[7]:基于18S核糖体DNA的内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)的通用引物,ITS1:5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’和ITS4:5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’,进行PCR扩增,反应体系见表1。反应条件:95℃预变性3 min;94℃变性1 min、55℃退火1min、72℃延伸1 min共计35个循环;72℃延伸10 min。扩增结束于4℃保存备用。(4)PCR产物检测:将扩增产物用1%琼脂糖凝胶电泳,观察是否有目的条带,将产物送往青岛擎科测序公司进行测序。(5)系统发育分析:对返回的测序结果用Geneious 8.0.3软件进行序列分析和校正,得到的高质量DNA序列上传到美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库的Genebank中进行同源序列Blast比对,寻找具有较高同源性的核苷酸序列,初步确定其发育地位,并下载相似度高的菌种序列及序列号。将各类菌株序列和比对结果导入Mega 7.0软件进行多序列比对(alignment)分析,采用最大似然法(Maximum Likelihood,ML)构建系统发育树。