《表4 rpoC1基因在不同模型下的参数估计值和对数似然值》

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《蕨类植物rpoC1内含子缺失及其分子进化速率》

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Np:参数编号；**后验概率P>99%；*后验概率P>95%

使用PAML软件codeml程序下的分支模型、位点模型和分支-位点模型分析rpoC1基因的适应性进化。在分支模型下进行单一比率和以海金沙属为前景支的二比率检验，得到单一比率似然值为–33 984.018 106，二比率似然值为–33 971.070 759（表4）。将单一比率和二比率进行似然值检验，得到P值为3.606×10–7（表5），表明单一比率模型和二比率模型差异显著，海金沙属与其它蕨类植物之间ω值差异显著。单一比率模型和自由比率模型在自由度为125、二倍对数似然值为169.474 0下进行卡方检验，P值为0.005，表明不同支系间的ω值差异显著。