《表2 各模型参数的估计值和对数似然值》
注:在95%和99%后验概率下检测出的正选择位点分别用“*”和“**”标出。
适应性进化分析中各模型选择位点的鉴定结果见表2和表3。分支模型中,二比率模型指定A~D 4个分支为前景支,其他是背景支。前景支C的ω估计值为16.49504,表明此分支可能存在正选择位点;前景支A、B、D的ω估计值均小于1,表明大多数分支均处于负选择压力下。自由比率模型中,检测到大多数分支ω值远小于1,仅有3个小分支的ω值大于1(CHAB2802分支的ω值为1.3454,CHAB2815和CHAB2823分支的ω值为999.0000),因此对这3个分支进行了分支-位点模型检测。对分支模型中二比率模型A~D以及自由比率模型H进行LRT检验(表2),结果表明各分支后验概率均不具有可靠性。
图表编号 | XD00139405000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.01 |
作者 | 王捷、魏爱丽、石瑛、李艳晖、韩雨昕、王中杰 |
绘制单位 | 太原师范学院生物系、太原师范学院生物系、太原师范学院生物系、太原师范学院生物系、山西大学生命科学学院、中国科学院武汉植物园中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |