《表2 各模型参数的估计值和对数似然值》

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《念珠藻属植物hetR基因的适应性进化分析》


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注:在95%和99%后验概率下检测出的正选择位点分别用“*”和“**”标出。

适应性进化分析中各模型选择位点的鉴定结果见表2和表3。分支模型中,二比率模型指定A~D 4个分支为前景支,其他是背景支。前景支C的ω估计值为16.49504,表明此分支可能存在正选择位点;前景支A、B、D的ω估计值均小于1,表明大多数分支均处于负选择压力下。自由比率模型中,检测到大多数分支ω值远小于1,仅有3个小分支的ω值大于1(CHAB2802分支的ω值为1.3454,CHAB2815和CHAB2823分支的ω值为999.0000),因此对这3个分支进行了分支-位点模型检测。对分支模型中二比率模型A~D以及自由比率模型H进行LRT检验(表2),结果表明各分支后验概率均不具有可靠性。