《表3 smg12突变体的候选SNPs分析》

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《一个新的OsBRI1弱等位突变体的鉴定及其调控种子大小的功能研究》

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我们利用Mutmap方法对突变体候选基因进行克隆（Abe et al.，2012；Takagi et al.，2015）。将野生型KYJ与突变体smg12杂交获得F1代，F1自交得F2代，从F2群体中挑取50株小粒矮秆表型植株进行等量混池测序，并且以F2代中与野生型表型相似的50株植株作为对照进行基因组重测序，然后进行SNP分析。结果显示，在smg12突变体中共检测到7 761个混池特异SNP，其中SNP＿index等于1的有12个（表3）。并且只有基因LOC＿Os01g52050中的碱基突变造成氨基酸突变，影响蛋白质编码。因此，基因LOC＿Os01g-52050为最佳候选基因。为了进一步验证smg12突变体的候选突变位点，我们根据LOC＿Os01g52050中的突变碱基设计dCAPS标记（表1）。利用该分子标记鉴定野生型KYJ和突变体smg12。结果显示，smg12能被相应内切酶正确切割而野生型KYJ不能被切开，且F2代群体中表型和基因型连锁，与预期结果相同（图3A，B）。因此，上述结果表明，smg12中确实存在C-T的突变。