《表1 AkMYB5修饰位点的预测》

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《狗枣猕猴桃AkMYB5基因的生物信息学分析》


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蛋白质磷酸化是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本、最普遍,也是最重要的机制,蛋白质的N-糖基化修饰是生物体调控蛋白质在组织和细胞中的定位、功能、活性、寿命和多样性的一种普遍的翻译后修饰。通过PredictProtein对N-糖基化位点进行预测,该蛋白内有6个潜在的N-糖基化位点,分别在150(NLSR)、209(NQSQ)、252(NFSE)、264(NLSK)、292(NFSF)及317(NSSS)氨基酸处。O-糖基化是另一种重要的蛋白质翻译后修饰,O-糖链能维持所连接蛋白质部分的空间构象。采用NetOGlyc4.0 server对O-糖基化位点进行预测,预测分数均大于0.5的认为是阳性,故推测该蛋白内含38个O-糖基化位点。Predict Protein预测分析结果见表1,可知AkMYB5含有6个糖基化位点(N-glycosylation site)、5个酪蛋白磷酸激酶Ⅱ磷酸化位点(Casein kinase II phosphorylation site)、5个十四烷酰化位点(N-myristoylation site)、1个酪氨酸激酶磷酸化位点(Tyrosine kinase phosphorylation site)、3个蛋白激酶C磷酸化位点(Protein kinase C phosphorylation site)、1个ATP/GTP结合位点(ATP/GTP-binding site motif A(P-loop))序列。