《表1 pol基因PCR扩增引物》

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《阜新市高效抗反转录病毒治疗的HIV/AIDS病人基因型耐药情况及影响因素》


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注:a:序列位置基于HIV-1模式毒株HIV-1 HXB2.K03455。

使用In-house法扩增HIV-1的pol区基因,包括蛋白酶基因全长(1~99密码子)和反转录酶基因前300个氨基酸(1~300密码子)。引物由invitrogen公司合成,引物序列见表1。第一轮荧光定量聚合酶链反应(PCR)如果以前病毒DNA为模板,以MAW-26和RT-21为引物,PCR反应条件如下:95℃预变性5 min,95℃30 s,56℃30 s,72℃2 min,40个循环,72℃延伸10 min,4℃保存,如果以RNA为模板,则在第一轮PCR反应前增加50℃30 min的反转录程序。第二轮PCR以第一轮PCR产物为模板,PCR反应条件如下:95℃预变性5 min,95℃30 s,56℃30 s,72℃1min,40个循环,72℃延伸10 min,4℃保存。