《表1 饲养方式对牦牛瘤胃微生物OTUs数量和Alpha多样性的影响》

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《不同饲养方式对牦牛瘤胃微生物区系及肌肉品质的影响》

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注：同行肩标小写字母不同表示差异显著（P<0.05）。下同。

舍饲牦牛与放牧牦牛OTUs数目和Alpha多样性指数见表1，放牧牦牛瘤胃微生物中表示微生物丰富度的OTUs数目显著高于舍饲牦牛瘤胃微生物（P<0.05），分别为2 543.40和1 742.00；同时放牧牦牛组中与样本的物种丰富度信息相关指标ACE、Chao1指数以及体现物种的丰富度和均匀度的Shannon指数和Simpson指数分别为2 925.87、3 002.86、9.56、0.99，前3项均显著高于舍饲牦牛组（P<0.05）。舍饲牦牛与放牧牦牛样品的覆盖率（coverage）均为0.99，表明本实验低丰度OTUs覆盖率及测序深度合理。本实验结果表明，放牧牦牛的瘤胃微生物多样性高于舍饲牦牛，而曹连宾等[16]选择了青海全放牧和舍饲牦牛各3头进行研究，结果表明舍饲牦牛的瘤胃微生物多样性高于放牧牦牛，与本研究结果相反。出现上述结果可能是动物品种不同、饲粮精粗比及成分不同等原因所造成。有大量的研究结果表明，日粮的组成不同，瘤胃微生物的组成会发生改变，许多瘤胃微生物菌群能够被扩大，或成为优势菌群[12，17-18]。