《表2 PDB中的结构类似蛋白》

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《条斑紫菜海藻酸盐裂解酶的生物信息学分析》


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模拟结果与PDB数据库中所有蛋白结构进行比对,结构越相似,功能也越相近,TM-分值相应越大,按照TM-分值的大小将比对出的前10种蛋白列于表2。其中RMSDa表示残基比对时的均方根偏差,IDENa表示比对区域所占比例,Cov表示比对的覆盖率。这10种蛋白为不同细菌来源的裂解酶,可见PyAly同样应具有裂解多糖的功能。