《表2 Ep CYP4C氨基酸组成》
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《太平洋真宽水蚤CYP4C和CYP44基因克隆及分子特征分析》
根据DNAMAN软件拼接获得太平洋真宽水蚤EpCYP4C全长cDNA序列2 032 bp(GenBank:MK327539),包括60bp 5’非翻译区,487 bp 3’非翻译区,3’末端具有多腺苷酸加尾信号(ATAAA)和poly(A)尾,开放阅读框(ORF)1 485 bp,编码494个氨基酸(图1A)。ExPAsy预测EpCYP4C基因分子式是C2526H3976N676O738S18,原子总数为7 934,分子量为56.2 kDa;理论等电点为6.34,其中带负电荷的氨基酸数量(Asp+Glu)是65,带正电荷的氨基酸数量(Arg+Lys)是61;富含亮氨酸(Leu,11.3%)(表2),不稳定指数40.34(>40),为不稳定蛋白质。PROSITE在线软件预测EpCYP4C蛋白具有CYP4家族特征序列EVDTFM-FEGHDTT(第295—307位氨基酸),CYP450蛋白特有的血红素结合区FxxGxxxCxG(FSAGPRNCI,第433—442位氨基酸),C螺旋保守区WxxxR(WGSRR,第121—125位氨基酸)和K螺旋保守区ExxR(ESLR,第360—363位氨基酸)(图1A)。经SMART预测发现EpCYP4C蛋白具有TM结构域(第2—21位氨基酸)和p450结构域(第31—490位氨基酸),未发现信号肽(图1A)。
图表编号 | XD00153503400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 周真真、曾善美、王斌、景斐、夏立萍、张建设 |
绘制单位 | 国家海洋设施养殖工程技术研究中心、国家海洋设施养殖工程技术研究中心、国家海洋设施养殖工程技术研究中心、国家海洋设施养殖工程技术研究中心、国家海洋设施养殖工程技术研究中心、国家海洋设施养殖工程技术研究中心 |
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