《表1 星油藤WOX转录家族成员特征分析》
利用本地BLASTN将拟南芥中15个WOX家族成员在本实验室的星油藤基因组数据库和星油藤转录组数据库中进行序列比对,并利用NCBI的BLASTP对预测的序列进一步鉴定分析,以筛选出WOX基因家族成员。结果显示,初步筛选得到了9个星油藤WOX家族基因成员,并获得了相应的DNA、CDS(Coding sequence)和预测的氨基酸序列。根据构建的进化树中与拟南芥的同源关系,分别将这些成员命名为PvoWUS、PvoWOX1、PvoWOX3、PvoWOX4、PvoWOX6、PvoWOX9、PvoWOX11、PvoWOX13a和PvoWOX13b。对星油藤WOX家族成员的序列分析发现(表1),它们基因的长度在967~2 212 bp之间,编码序列的长度663~1 209 bp之间。对它们的蛋白序列分析发现它们的氨基酸长度在220~402个之间,蛋白的分子量在24 948.03~45 365.18 Da之间,等电点在5.45~9.12之间。根据星油藤WOX家族不同成员之间理化性质的差异可推测它们可能具有不同的生物学功能。
图表编号 | XD00152917800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.28 |
作者 | 郭亚静、付乾堂、胡晓笛、陈茂盛、潘帮珍、陶彦彬、何惠英、徐增富 |
绘制单位 | 中国科学院西双版纳热带植物园种子创新研究院热带植物资源可持续利用重点实验室、中国科学院大学生命科学学院、中国科学院西双版纳热带植物园种子创新研究院热带植物资源可持续利用重点实验室、中国科学院西双版纳热带植物园种子创新研究院热带植物资源可持续利用重点实验室、中国科学院西双版纳热带植物园种子创新研究院热带植物资源可持续利用重点实验室、中国科学院西双版纳热带植物园种子创新研究院热带植物资源可持续利用重点实验室、中国科学院西双版纳热带植物园种子创新研究院热带植物资源可持续利用重点实验室、中国科学院西双版纳热带植物 |
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