《表1 5种方法提取的RNA质量》
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《适用于转录组测序的毛葡萄叶片总RNA提取方法筛选》
注:-:未检测该值
OD260/OD280比值是衡量RNA纯度的指标,高质量的RNA,OD260/OD280比值在1.8~2.2之间,OD260/OD230>1.8。5种方法提取的RNA质量差别较大(表1),提取的RNA原液浓度分别是501 ng/μL、710 ng/μL、723 ng/μL、102 ng/μL、122 ng/μL,均可以满足RNA-seq对样品浓度的要求,但是试剂盒B和C提取的总RNA浓度相对较低。5种方法提取的毛葡萄叶片总RNA OD260/OD280比值分别是1.96、2.05、2.07、1.61、1.52,OD260/OD230比值分别是1.46、1.71、2.06、0.56、0.97;采用改良CTAB、改良SDS/酚和试剂盒A法提取的RNA OD260/OD280比值介于1.8~2.2之间,说明没有蛋白质等有机物污染,改良CTAB和SDS/酚法提取的RNA OD260/OD230比值小于1.8,说明有盐、多糖、多酚等污染,这种纯度的RNA可以满足普通RT-PCR的试验需求,但不能满足RNA-seq测序要求。试剂盒B和试剂盒C提取的总RNA OD260/OD280和OD260/OD230均不在要求范围内,不满足RNA-seq测序要求。
图表编号 | XD00152903800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.14 |
作者 | 张树伟、丁峰、黄羽、彭宏祥、卢江 |
绘制单位 | 广西农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室、广西农业科学院园艺研究所、广西农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院园艺研究所、广西农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室 |
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