《表3 2014～2018年临沧市H3N2亚型流感病毒HA蛋白氨基酸突变位点分析》

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《新一代全基因组测序揭示2014～2018年云南省临沧市H3N2亚型流感病毒的遗传突变机制》

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注：氨基酸比对参照A/Texas/50/2012，“a”表示受体结合位点，“.”为氨基酸位点与A/Texas/50/2012对应位点相同。

29株H3N2亚型流感病毒HA蛋白的裂解位点序列为PEKQTR↓G或PERQTR↓G，均含有碱性氨基酸R，属于低致病性流感病毒。与WHO推荐的北半球2014～2015年度疫苗株A/Texas/50/2012的HA氨基酸序列相比，29株H3N2流感病毒HA蛋白共发生42处位点变异（不包含信号肽），32处位于HA1，10处位于HA2区，分别占76.2%与23.8%（表2和表3）。HA蛋白共有5个抗原决定簇（A-E），全部位于HA1亚基[11]，29株病毒株在5个抗原决定簇上共有29处位点发生突变，位于抗原表位A区的N145S、B区的V186G和D区的F219S已形成适应性变异。突变位点统计分析发现归属3C.2a1进化分支的11株毒株几乎都发生了L3I(10/11株）、N128T(10/11株）、F159Y、K160T和D489N变异，其中部分毒株还发生了K92R(7/11株）、N121K(8/11株）、T135K(7/11株）、N144S(8/11株）、N171K(7/11株）、Q311H(4/11株）、I406V(7/11株）、G484E(7/11株）变异，已有文献报道N121K、N171K、I406V和G484E这四个位点变异具有3C.2a1新进化分支的专属性[12]，所以这很好地解释了为什么这11株毒株并入3C.2a1进化簇。A/Yunnan-Linxiang/114/2018毒株独具K83R、N122D、L157S、Q197H和D225N变异，并入3C.3b进化分支[10]。从表2和表3还可以看出HA蛋白N128A、A138S、F159S、K326R突变是3C.3a进化分支的代表性突变位点，这与相关文献报道一致[13]。隶属3C.2a1进化分支的2016～2018年10株毒株还在受体结合位点134～138残基处[14]发生了T131K或T135K/N(A区）变异，这与归属3C.3a进化分支的17株毒株发生在抗原决定簇A138S(A区）的突变同属RBS突变。有研究报道流感病毒HA突变位点如同时属于抗原决定簇和RBS及其附近位点，则被认为是抗原漂变的决定位点[11]。