《表1 NIPBL基因引物序列》

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《2例Cornelia de Lange综合征患儿NIPBL基因突变研究》


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采集患儿及其父母空腹静脉血各2 m L(EDTA抗凝),采用QIAamp DNA提取试剂盒(QIAGEN公司)提取基因组DNA,DNA酶片段化后用磁珠法纯化,随后进行PCR扩增并连接接头序列,经定制的Panel探针(illumina Inc,USA)两次捕获及纯化,经PCR扩增和纯化,获得最终文库,在Next Seq500测序仪(illumina Inc,USA)上对Panel基因NIPBL、SMC1A、SMC3、HDAC8、RAD21、EP300和ANKRD11的外显子区进行测序。对可疑候选突变的位点设计PCR引物进行扩增及进行Sanger测序验证,并对患儿父母的相应位点进行检测(广州金域医学检验中心完成)。患儿1测序平均深度176.14,覆盖率≥20X为98.19%;患儿2测序平均深度114,覆盖率≥10X为97.65%。引物设计根据Gene Bank人类NIPBL基因序列(NG_006987.1),见表1。