《表1 瘤胃微生物细菌主要菌群》

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《瘤胃微生物宏组学分析及研究进展》

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瘤胃微生物是反刍动物进行饲草料降解的重要部分。宏基因组学最初的研究是确定反刍动物瘤胃内的微生物主要种类及优势菌群。不同反刍动物在门水平瘤胃微生物优势菌群不同[5-12]（表1），其中大部分是硬壁菌门、拟杆菌门、变形菌门。而对RDP数据库中所有瘤胃来源的16S rRNA基因序列进行分析，也表明瘤胃中大部分细菌属于厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门[13]。厚壁菌门是分解纤维的主要菌门，含有大量的降解纤维素的菌属[14]。