《表1 菌群引物序列:藏绵羊暖、冷季瘤胃微生物菌群密度与其短链脂肪酸浓度互作分析》
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《藏绵羊暖、冷季瘤胃微生物菌群密度与其短链脂肪酸浓度互作分析》
表示细菌是管家基因序列16S rRNA序列
以瘤胃微生物DNA为模板,选取产甲烷菌(Methanogenic bacteria)、蛋白质降解菌(包括溶纤维丁酸弧菌和嗜淀粉瘤胃杆菌)、纤维降解菌(产琥珀酸丝状杆菌、黄色瘤胃球菌和白色瘤胃球菌)进行相对定量研究。利用NCBI BLAST(www.ncbi.nih.gov/BLAST)搜寻菌群16S rRNA序列,采用Primers软件设计特异性引物(表1),引物由上海生物工程有限公司合成。以细菌为内参,引物序列参考Muyze等[17]研究方法,利用荧光定量PCR仪(ABI QuantStudio-6)测定微生物黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌、白色瘤胃球菌、嗜淀粉瘤胃杆菌、溶纤维丁酸弧菌和产甲烷菌的相对密度。PCR反应体系20μL:2×SuperReal PreMix Plus 10μL,上、下游引物各0.6μL,模板1μL,50×Rox Reference Dye 0.4μL,ddH2O 7.4μL。反应参数:95℃预变性15 min;95℃变性10 s,60℃退火32 s,共40个循环。
图表编号 | XD00192934800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.01 |
作者 | 史浩、沙玉柱、魏红、吕卫兵、文禹梁、刘秀、罗玉柱、王继卿、李少斌、胡江 |
绘制单位 | 甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室、甘肃农业大学动 |
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