《表4 本研究所获得S、M、N基因序列分布情况》

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《2017—2019年猪流行性腹泻病毒广西流行毒株遗传多样性分析》


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基于S、M、N基因核苷酸序列,将本研究所获得序列与国内外参考毒株序列共同绘制遗传进化树。结果显示,可将S基因序列分为4个亚群(图4):以CV777株为代表的GⅠa亚群(图中“●”标注部分),以KNU-1406-1株为代表的GⅠb亚群(图中“■”标注部分),以AJ1102株为代表的GⅡa亚群(图中“▲”标注部分),以USA-Colorado-2013株为代表的GⅡb亚群(图中“◆”标注部分),广西流行毒株(图4中加粗、红色标注毒株)分布在GⅠb、GⅡa亚群。可将M基因序列分为3个亚群(图5):以CV777株为代表的GⅠ亚群(图中“●”标注部分),以AJ1102株为代表的GⅡa亚群(图中“■”标注部分),以KNU-1406-1株、USA-Colorado-2013株为代表的GⅡb亚群(图中“▲”标注部分),广西流行毒株(图5中加粗、红色标注毒株)分布在GⅡa、GⅡb亚群。可将N基因序列分为3个亚群(图6):以CV777株为代表的GⅠ亚群(图中“●”标注部分),以AJ1102株为代表的GⅡ亚群(图中“■”标注部分),以KNU-1406-1株、USA-Colorado-2013株为代表的GⅢ亚群(图中“▲”标注部分),广西流行毒株(图6中加粗、标注毒株)分布在GⅢ亚群。广西流行毒株在各亚群的分布情况见表4。