《表3 本研究线虫与GenBank上同种线虫的ITS基因序列差异》

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《细口杯环线虫形态学和分子特征分析》


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多态位点代码:Y=C或T;R=G或A;M=A或CPolymorphic site code:Y=C or T;R=G or A;M=A or C

测序结果显示获得预期结果,除去通用引物,所得序列总长837bp,其中ITS1长366bp,5.8S长153bp,ITS2长318bp;ITS1的GC含量(46.0%)明显高于ITS2(39.8%)。所测序列提交至GenBank数据库,登录号为:KP693432。通过检索发现,与GenBank上已注册的同种线虫序列(登录号:AJ004849+Y08587)同源性达99.85%;比对结果显示,ITS1区差异性为0,ITS2区差异性为0.31%;两条序列中存在3处多态性位点和1处碱基差异位点(ITS1区域有2处多态性位点;ITS2区域有1处碱基差异和1处多态性位点)(表3) 。