《表2 颚口线虫CO1基因序列分析》

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《广州市市售部分水产品颚口线虫感染状况调查》


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利用DNA提取试剂盒,提取虫体基因组DNA,-20℃保存备用。参考李树清等[7-9]的引物信息,由昊天生物有限公司合成,以核糖体DNA第二内转录间隔区(ITS2)与线粒体细胞色素C氧化酶第一亚基(CO1)为模板进行扩增[10]。PCR反应体系和反应条件均参考李树清等[7]的方法。产物送昊天生物有限公司进行测序,获得完整序列。在Genbank上获取旋尾目,颚口线虫科的已登录的ITS2和CO1基因序列(序列信息见表1、2);以旋尾目,筒线科,美丽筒线虫的ITS2(登录号AB495389)与CO1(登录号AB513730)基因作为外类群。利用MEGA6的Kimura 2-parameter模型使用邻接法构建进化树,自展值重复1 000次,对虫种进行分型鉴定。