《表2 26个物种CRY1基因的ENc、GC、GC1s、GC2s和GC3s》
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《苋菜蓝光受体基因AmCRY1密码子使用模式及分析》
密码子选择偏好性相关参数(表2)显示,26种物种的CRY1基因ENc值在47.49-56.66之间,平均值为51.24.一般来说,ENc值越小表明该基因的表达水平越高,ENc值小于30和大于55的基因则可分别被预测为高表达和低表达基因.其中CRY1基因的ENc值大于55的有蕨类植物铁线蕨,藤本植物南瓜、西葫芦、苦瓜和草本植物芡欧鼠尾草5种植物.从数据看,铁线蕨,藤本植物南瓜、西葫芦、苦瓜和草本植物芡欧鼠尾草5种植物的CRY1表达水平偏高.26种植物CRY1基因的GC含量除铁线蕨、苦瓜和小果野蕉外,均小于50%.CRY1基因的GC1s含量大于50%,GC2s和GC3s含量均小于50%.这预示除铁线蕨、苦瓜和小果野蕉外的23种植物的CRY1均对A/T有一定的偏好,而苦瓜的CRY1基因对A/T和G/C的选择并无偏性.
图表编号 | XD00142344700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.25 |
作者 | 王晓、赵春丽、彭丽云、赖钟雄、刘生财 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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