《表2 不同物种DREB的ENc、GC、GC3s和CAI分析》
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《小麦抗逆相关转录因子DREB密码子偏好性特征分析》
运用CodonW和CHIPS在线程序,计算得出小麦DREB的ENc值、GC含量和GC3s值分别为54.00、0.518和0.481,其中,ENc值大于35,偏向于61,表明在小麦中该基因对密码子选择偏性比较弱,且表达水平偏低(表2)。DREB编码区GC含量为51.8%,基因编码区序列中AT(48.2%)与GC含量(51.8%)含量基本相当,略微偏好于使用以GC结尾的密码子。小麦DREB的GC3s为0.481,表明了小麦DREB密码子第三位碱基偏好使用以AT结尾。小麦DREB的CAI值为0.262,远小于1,进一步表明小麦DREB对密码子的偏好性偏弱,可能在不同组织中的表达水平普遍偏低。
图表编号 | XD0037970400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.15 |
作者 | 雷梦林、冯瑞云、郝雅萍、刘霞、王慧杰、杨生权 |
绘制单位 | 山西省农业科学院农作物品种资源研究所、农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室、杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室、山西省农业科学院作物科学研究所、作物遗传与分子改良山西省重点实验室、山西省农业科学院作物科学研究所、作物遗传与分子改良山西省重点实验室、山西省农业科学院农作物品种资源研究所、农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室、杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室、山西省农业科学院作物科学研究所、作物遗传与分子改良山西省重点实验室、山西省生物研究所 |
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