《表2 芯片杂交结果:利用马克隆值差异显著的BILs鉴定棉纤维品质相关基因》

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《利用马克隆值差异显著的BILs鉴定棉纤维品质相关基因》


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从图1中可以看出NMGA-140与NM-GA-051中基因表达量的比例信息和信号强度的关系。在基因表达谱的散点图上,每1个点表示1个基因。散点图中共有8条斜线,平行对称分布着2倍、3倍、10倍、30倍Fold change lines,它们由上至下分别为30、10、3、2、-2、-3、-10和-30。图1结果显示基因表达谱中基因分布较为分散,2和-2线外存在大量的信号信息(NM-GA-051和NMGA-140信号比值为±2),表明通过分析比较2张芯片得到了大量的差异表达基因。棉花基因组芯片共有24 029个探针组成,从表2中可以看到NMGA-140中有13 198个探针信号检测到(55%),NMGA-051中有13 736个探针信号检测到(57%)。NMGA-051(马克隆值4.0)比NMGA-140(马克隆值6.2)检测到了更多的探针信号。根据ratio>2.0和ratio<0.5的标准,通过分析比较NMGA-140和NMGA-051共筛选得到2 655个差异表达基因,其中1 765个基因在NMGA-140中高表达,而890个基因在NM-GA-051中高表达。