《表2 倍数变化较大的差异表达显著的线粒体相关基因》
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《原发性干燥综合征线粒体功能相关基因表达的转录组学分析》
本文在pSS组和正常组的基因表达谱中,采用t检验和FC的差异基因分析方法设置FDR<0.05且表达值变化1.5倍以上共筛选出347个pSS相关的显著差异表达基因(见表1)。其中,显著差异表达的线粒体相关基因有61个。在60个上调的基因中,pSS组相对于正常组基因表达值的倍数变化在2倍以上的基因有UQCRQ、XAF1、ND-UFA4、MRPS28、IFIT3、OAS1、IFI6、CMPK2和IFI27,1个下调的基因为MYH9,详细的信息见表2。其中,倍数变化最大的基因是IFI27即干扰素诱导蛋白27,其FC值为23.35(10.23)。另外,本文使用的基因表达谱数据中检测了6个线粒体基因,分别为MT-ND6、MT-CO2、MT-ND2、MT-CO1、MT-ND4和MT-ATP6,而MT-ND2基因即泛醌氧化还原酶核心亚基2表现出基因表达值的下调,pSS组的基因表达值是正常组的0.61倍。由此说明了pSS的发生伴随着部分线粒体功能相关的基因表达的失调。由此推测线粒体功能的异常在pSS中的发生发展中发挥一定的作用,但具体的机制尚不明确。火山图见图1。
图表编号 | XD00100312700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.28 |
作者 | 巴燕娜、苏丽萍、袁晴、董海莹 |
绘制单位 | 第四军医大学西京医院临床免疫科、第四军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室、第四军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室、第四军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室 |
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