《表7 SARS-CoV-2病毒主要蛋白的选择进化压力分析》

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《新型冠状病毒SARS-CoV-2的变异和进化分析》


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我们将变异序列导入http://www.datamonkey.org/中,分析其变异是否存在选择压力。如表7所示,参与病毒复制相关蛋白有48处变异位点,采用固定效应似然比检验模型(FEL)发现有4处存在净化选择,而采用相对保守的方法单一似然祖先计数(SLAC)法只能检出一个位点。在S蛋白、M蛋白和N蛋白中只能用FEL法检出具有统计学意义的2~3种净化选择,在N蛋白中检出1种正向选择进化。